これは、先ほど(?)quartaさんより頂いたdeepな投げ込み、ご質問に対してのエントリーです。
僕は脳が臓器かどうかということにはほとんど関心がありませんし考えたこともありません。明らかに独立した特定の機能を持つ一塊の存在があるというだけの理解です。胴体の中にあるものが臓器だと考える人には臓器ではないと思うし、それはそれで好きにしてくださいという感じです。:)
あまりにも素朴に考えすぎなのかもしれませんが、そこに研究の対象とすべき大きな存在がある、ということで十分ではないかと思っています。いかがでしょうか。
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